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今天11月1日周日5 条
  1. NCBI GEO · 每日新增数据集46

    单细胞图谱揭示结直肠息肉发生早期共同的微环境重塑(GSE327909)

    研究对3名患者的正常黏膜与结直肠息肉配对组织进行单细胞RNA测序,获得31,147个高质量细胞,构建早期共同微环境重塑图谱。四项特征为上皮稳态破坏、CD4+ T细胞促炎极化、CD8+ T细胞功能重编程及免疫—上皮通讯广泛重塑,涉及CD55-ADGRE5、MIF-CD74和GZMA-PARD3信号轴。

  2. NCBI GEO · 每日新增数据集42

    NCBI GEO 数据集 GSE349296:KLF16 与 SIN3A 通过 CTD-2377D24.6 促进子宫内膜癌细胞增殖

    NCBI GEO 数据集 GSE349296 收录 KLF16/SIN3A/CTD-2377D24.6 调控轴促进子宫内膜癌细胞增殖的研究。KLF16 在子宫内膜癌组织中显著升高,敲低后在体外抑制增殖、在体内减缓肿瘤生长;CTD-2377D24.6 过表达可抵消这一抗增殖效应,实验显示 SIN3A 与 KLF16 相互作用。

  3. NCBI GEO · 每日新增数据集71

    Spatial-GT-seq 空间基因组与转录组联合定位揭示肿瘤组织克隆异质性(GSE276211)

    研究团队提出 Spatial-GT-seq,可在同一肿瘤组织中以近单细胞分辨率联合检测基因组和转录组。在肺转移小鼠模型中,团队原位识别出肿瘤亚克隆,并发现同一克隆的基因表达会随肿瘤微环境改变。对原发和复发的人胰腺神经内分泌肿瘤分析还显示存在持续克隆与新出现克隆,且转录表达发生变化。

    同一件事,精选收录的是《Spatial-GT-seq 联合定位肿瘤基因组与转录组揭示克隆异质性(GSE276212)》

  4. NCBI GEO · 每日新增数据集74

    Spatial-GT-seq 联合定位肿瘤基因组与转录组揭示克隆异质性(GSE276212)

    GEO 数据集 GSE276212 收录的 Spatial-GT-seq 研究,在同一肿瘤组织中以近单细胞分辨率联合分析基因组与转录组。在肺转移小鼠模型中,研究识别出肿瘤亚克隆,并显示同一克隆的基因表达谱会受到肿瘤微环境改变。对原发与复发人胰腺神经内分泌肿瘤的分析则识别出持续存在和新出现的亚克隆,两处样本均出现转录变化。

    推荐理由:Spatial-GT-seq 将基因组与转录组在近单细胞分辨率下联合定位,可用于研究肿瘤亚克隆、转录状态与微环境之间的关联。

10月30日周五
10月29日周四
  1. Arc Institute · News82

    Evo 2 利用上下文学习以数十个示例从头设计调控序列

    Arc Institute 团队在两篇 bioRxiv 预印本中报告,Evo 2 仅用 4–64 个上下文示例且无需额外训练,即可生成覆盖 5 类调控模式的功能序列。

    推荐理由:Evo 2 以少量上下文示例完成五类调控序列设计,并经 AAV 递送在小鼠脑内验证,为低样本生物序列生成提供了可复用路径。

10月28日周三
  1. 晶泰科技 XtalPi67

    晶泰科技 KQTD-126 获 FDA 临床试验许可

    晶泰科技自主研发的肠道限制性高选择性 pan-TRK 抑制剂 KQTD-126 获得 FDA 新药临床试验(IND)许可,计划近期启动临床试验。研发过程结合 AI 驱动的分子设计与机器人实验验证,临床前研究显示其 IC₅₀<1 nM,肠道组织与血液暴露量比值超过 1000:1。下一阶段将评估人体安全性、耐受性和药代动力学特征。

    推荐理由:公开了候选药物的临床前活性与暴露量数据,可用于判断其肠道选择性及后续临床评估重点。

10月27日周二
  1. NVIDIA Blog61

    NVIDIA 与 C-BRAIN 合作如何用 AI 加速 Alzheimer’s 病研究

    NVIDIA 与 C-BRAIN 正利用 AI 和加速计算整合 Alzheimer’s 研究数据,并将部分分析从数周至数月缩短至数分钟。C-BRAIN 由 18 家机构组成,目前运行 64 块 NVIDIA 数据中心 GPU,并结合 Microsoft Azure 云节点,正与 NVIDIA 引入 NVIDIA BioNeMo 和 MONAI 技术。

    推荐理由:文中给出 dark data 的混合集中与联邦处理方案,以及两个 agentic AI 工具的耗时与成本表现,便于理解 Alzheimer’s 研究的提速路径。

  2. 晶泰科技 XtalPi52

    挑战“不可成药”三十余年,Gregory Verdine 与晶泰科技推进 AI 机器人难成药靶点合作

    晶泰科技与 DoveTree Medicines 创始人 Gregory Verdine 推进 AI 与机器人结合的难成药靶点研发合作。Verdine 是哈佛大学化学荣休教授,其参与推动的胰腺癌新药 daraxonrasib 于 2026 年 8 月 26 日获 FDA 批准,III 期临床中位总生存期 13.2 个月,对照组为 6.7 个月。

10月26日周一
  1. 晶泰科技 XtalPi42

    晶泰科技入选港交所人工智能指数,权重位列前十

    香港交易所近日推出香港交易所人工智能指数,晶泰科技(02228.HK)成为首批成份股之一,权重位列前十。该指数纳入40家香港上市公司,覆盖AI芯片、基础设施、模型及应用,纳入企业须有至少30%的收入来自AI相关业务。指数明确覆盖科学领域AI应用,晶泰科技则持续构建融合AI与机器人自主实验室、面向药物发现的技术平台。

10月24日周六
  1. Google Research78

    Google 在 IDWeek 2026 介绍 MedGemma 等基础模型的结核筛查实践

    Google Research 在 IDWeek 2026 介绍了以 MedGemma、MedSigLIP 和 HeAR 为基础的结核筛查实践,覆盖胸片筛查、咳嗽声分诊和多模态临床推理。

    推荐理由:从多中心验证、监管认证到六国诊所部署,文中用阅片量、周转时间和本地化方案呈现基础模型进入结核筛查流程的路径。

10月22日周四
10月21日周三
  1. 晶泰科技 XtalPi42

    国家数据集团成立,AI for Science将加快释放科研数据价值

    10月20日,国家数据集团正式成立,将推进数据资源开发利用、释放数据要素价值并服务人工智能发展。晶泰科技“AI+自动化技术赋能研发数据要素构建及应用”项目获2025年“数据要素×”大赛开放创新赛道全国总决赛唯一一等奖。其以AI、物理仿真及自动化实验平台协同,规模化生产真实实验数据并反馈至AI模型,形成研发迭代闭环。

10月20日周二
  1. Arc Institute · News64

    Arc Institute 发布 Bolero 细胞状态条件序列模型

    Arc Institute 发布 Bolero,以细胞状态嵌入动态调节序列到功能的 Transformer 模型,并将论文发布至 bioRxiv。模型使用原始 DNA 序列和源自 10.8-million-cell atlas 的 cell-state embedding,直接预测细胞状态特异的转录本丰度与染色质可及性。

    推荐理由:Bolero 展示了按细胞状态动态生成网络权重的方法,并给出跨物种预测、疾病变异评分和增强子设计案例。

10月17日周六
  1. Google Research77

    Google Research 介绍 VERID、适配体闭环发现与 de novo 蛋白设计研究

    Google Research 展示 VERID 数字孪生框架、适配体闭环发现和 de novo 蛋白设计三项研究,让 AI 智能体参与湿实验执行与迭代。VERID 以实时 3D 状态跟踪、数秒虚拟 dry run、硬件安全检查和同步视频与执行日志,在试剂接触前拦截碰撞、空孔及物理上不可执行的命令。

    推荐理由:分别呈现数字孪生预检、闭环实验和 AI 智能体辅助蛋白设计,并给出命中率、特异性及计算效率数据,便于比较其技术路径。

10月16日周五
  1. Google DeepMind60

    Google Antigravity 新增 Biomolecular Structure Viewer,加速抗菌肽搜索

    Google Antigravity 引入 Biomolecular Structure Viewer,为研究者与 AI 智能体提供共享的 3D 结构查看和注释工作区。在抗菌肽案例中,ProtNLM 从 UniProt 原始氨基酸序列预测生物功能,平台结合结构与基因组证据筛出面向 Streptococcus pseudopneumoniae 的候选物。该候选物目前正在进行湿实验验证。

    推荐理由:技术演示呈现了 UniProt 功能预测、跨库检索和 3D 结构分析的一体化流程,提供了可迁移的候选抗菌肽筛选方法。

10月15日周四
  1. 晶泰科技 XtalPi63

    晶泰科技首个 siRNA 项目 9 个月确认 PCC,支持同类最佳潜力

    晶泰科技宣布,其首个 siRNA 项目借助 Kodexia™ 平台在立项后 9 个月确认 PCC,拟用于治疗 IgA 肾病。体外评价显示,候选分子具有亚纳摩尔级沉默活性,IC50 较同靶点临床阶段参照分子降低数十倍;在非人灵长类研究中,其药效活性与持续时间均优于参照分子,单次给药后数月维持高水平靶蛋白抑制,毒理试验观察到较低毒性。

    推荐理由:项目给出候选分子与同靶点临床阶段参照物的体外、动物及毒理对比数据,可用于评估 siRNA 的 BIC 潜力与平台验证价值。

  2. Google Research60

    Google Earth AI 更新 Geospatial Reasoning Agent,发布两项基准并扩大早期访问

    Google Earth AI 更新 Geospatial Reasoning Agent,加入多步骤推理的前置规划与私有数据接入,并发布 GeoExpertQueries 和 GeoKTools 的开发集。

    推荐理由:四个基准的对照结果与合作方实测并列呈现,为评估地理空间智能体的工具收益、规划作用和早期使用范围提供具体参照。

10月14日周三
  1. 晶泰科技 XtalPi52

    晶泰科技旗下 Ailux 任命 Lloyd S. Miller 博士为首席医学官

    由晶泰科技创立并控股的 Ailux 任命 Lloyd S. Miller 博士为首席医学官(CMO),负责领导 AI 原生大分子药物的临床开发。Miller 博士拥有 25 年产业及学术经验,曾任强生创新制药高级副总裁兼转化科学与医学全球负责人,并将建立美国临床与研究基地。首批 AI 原生大分子药物项目计划于 2027 年进入临床阶段。

  2. Google DeepMind62

    Google DeepMind 开始广泛推出 Gemini 4 Argon 并扩展 Fairwind Program

    Google DeepMind 开始广泛推出 Gemini 4 Argon,并将 Fairwind Program 扩展至更多受信网络防御者。此前,Wiz 用它发现前代模型遗漏的医院软件关键漏洞,帮助保护数十万份患者记录,Google 安全团队也用它查找并修补内部及开源软件漏洞。

    推荐理由:Google DeepMind 详述了 Gemini 4 Argon 的分层防护与实时监控方法,为高能力智能体的越权和提示注入防护提供可借鉴设计。

10月13日周二
  1. Arc Institute · News69

    Arc Institute 等团队用 eclair-CLIP 构建 67 种 RNA 结合蛋白图谱

    Arc Institute、Biohub、UCSF 和 Vector Institute 团队开发 eclair-CLIP,并为人类细胞中的 67 种癌症相关 RNA 结合蛋白建立图谱,在单核苷酸分辨率下映射超过 9 million 个 RNA 结合位点。

    推荐理由:文章说明统一小标签和红外检测如何减少 CLIP-seq 对特异性抗体与放射性标记的依赖,并展示图谱进入模型训练后的应用路径。

10月7日周三
  1. Isomorphic Labs · News66

    Isomorphic Labs 加入 Virtual Biology Initiative 共建 AI 生物基础数据

    Isomorphic Labs 以创始成员身份加入 Virtual Biology Initiative,参与建设用于预测生物学、支持疾病研究与治疗的 AI-ready 生物数据开放资源。该倡议由 Biohub 召集,参与组织将投入资金、数据、算力和新的测量技术。

    推荐理由:Isomorphic Labs 以创始成员身份参与跨组织计划,相关组织将投入资金、数据、算力和新测量技术,推动形成开放的生物数据资源。

10月6日周二
  1. Arc Institute · News82

    Arc Institute 发布利用人工整理生物知识的虚拟细胞模型 PIE

    Arc Institute 发布虚拟细胞模型 PIE,利用人工整理的生物知识预测未见细胞情境、扰动及其组合中的群体响应。在各设置下,PIE 分类差异表达基因的 AUPRC 达到最强竞争方法的 1.2 to 3.2 times,未见扰动时增幅最大,但情境与扰动均未见时准确率会下降。完整代码、训练与评测流水线已上 GitHub,模型检查点和处理后的公开数据集已发布在 Hugging Face。

    推荐理由:PIE将人工整理的生物知识作为输入,并给出跨未见扰动、细胞情境和数据集的对比结果,便于理解其泛化范围与限制。

9月30日周三
  1. Broad Institute · News69

    Broad Institute 构建免疫细胞图谱,揭示遗传变异致病机制

    Broad Institute 构建了包含来自超过 1,100 名芬兰献血者的 10 million 个以上免疫细胞图谱,用于关联疾病相关调控变异与其控制基因。方法以染色质可及性及其与邻近基因表达的关联为基础,识别更可能致病的遗传变异,并观察细胞如何缓冲关键基因表达。

    推荐理由:该图谱将疾病相关调控变异与其控制基因相连接,并呈现细胞缓冲关键基因表达的方式,为遗传变异致病机制研究提供细胞级线索。

9月29日周二
9月16日周三
  1. Broad Institute · News63

    Broad Institute 推出 Delphy,快速构建高准确度病毒系统发育树

    Broad Institute 研究人员创建网页应用 Delphy,用于根据病毒基因组数据实时绘制病毒演化图谱。它构建病毒系统发育树的速度比现有方法快 100 至 1,000 倍,同时保持准确性。公共卫生人员可将其用于疫情响应中的病毒变异追踪。

    推荐理由:Delphy 将病毒系统发育树构建提速 100 至 1,000 倍并保持准确性,为公共卫生人员快速追踪病毒变异提供了可用的计算工具。

7月15日周三
  1. Chai Discovery · News46

    argenx 将提前获得 Chai Discovery AI 平台访问权限,支持针对治疗靶点的 de novo 抗体发现

    argenx 将提前获得 Chai Discovery AI 平台的访问权限,并把 de novo 抗体发现应用于治疗靶点探索。Chai-2 于 2025 年成为首个实现两位数实验命中率的 zero-shot 抗体设计平台,较此前计算方法提升 100 倍;最新模型 Chai-3 在治疗性结合、难成药靶点、多特异性设计、可成药性和泛化能力上进一步提升性能。

7月14日周二
7月13日周一
  1. Chai Discovery · News53

    Chai Discovery 与 Novartis 达成 AI 抗体设计合作

    Chai Discovery 宣布与 Novartis 建立合作,Novartis 将获得其最新 AI 模型(包括 Chai-3 模型)与平台,用于多个靶点的治疗性抗体发现。此次合作建立在双方一年多技术接触的基础上,去年春季 Novartis 曾早期接触 Chai 的下一代折叠模型。这是 Chai 继 Pfizer 和 Eli Lilly 之后公布的又一项客户协议,财务条款未披露。

5月12日周二
2月10日周二
  1. Isomorphic Labs · News78

    Isomorphic Labs 推出 IsoDDE 药物设计引擎

    Isomorphic Labs 推出 IsoDDE 药物设计引擎,用统一系统处理结构预测、结合亲和力预测和新型口袋识别。在‘Runs N’ Poses 基准最困难的外推类别中,IsoDDE 的准确率是 AlphaFold 3 的两倍以上,并在抗体-抗原高保真预测中分别比 AlphaFold 3 和 Boltz-2 高 2.3 倍和 19.8 倍。

    推荐理由:IsoDDE将结构预测、亲和力预测和口袋识别纳入统一系统,并提供训练集外任务与公开基准的对比结果。

2025年12月15日周一
2025年11月20日周四
2025年11月19日周三
2025年9月4日周四
  1. Broad Institute · News55

    Mass General Brigham推出八种心血管疾病遗传风险检测

    Mass General Brigham推出由临床医生订购的遗传检测,可估算个体在8种慢性心血管疾病中的遗传风险,现已面向患者开放自费使用。检测使用All of Us Research Program中236,393人的基因型和临床数据,通过PRSmix整合各疾病的多基因风险评分,并在Mass General Brigham Biobank的53,306人独立队列中完成外部验证。