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11月1日周日
  1. bioRxiv · Bioinformatics53

    tWhEEL:利用转录组组装量化 CRISPR 敲除可行性的流程

    tWhEEL通过转录本信息推断基因冗余,并将其与CRISPR-Cas9候选guide RNA设计交叉匹配,为单个基因和功能类别计算敲除可行性指数KFI。流程整合GO与通路注释,生成可交互HTML报告,串联相关基因、候选靶位点和QuickGO或WikiPathways链接。酵母和斑马鱼数据集呈现不同靶向特征,斑马鱼Fanconi贫血案例从已发表设计中找回19个靶位点中的14个。

  2. NCBI GEO · 每日新增数据集42

    NCBI GEO 数据集 GSE349296:KLF16 与 SIN3A 通过 CTD-2377D24.6 促进子宫内膜癌细胞增殖

    NCBI GEO 数据集 GSE349296 收录 KLF16/SIN3A/CTD-2377D24.6 调控轴促进子宫内膜癌细胞增殖的研究。KLF16 在子宫内膜癌组织中显著升高,敲低后在体外抑制增殖、在体内减缓肿瘤生长;CTD-2377D24.6 过表达可抵消这一抗增殖效应,实验显示 SIN3A 与 KLF16 相互作用。

2025年7月24日周四
  1. Broad Institute · News78

    Broad Institute与NEIDL用光学池化CRISPR筛选识别Ebola潜在药物靶点

    Broad Institute与Boston University的NEIDL用光学池化筛选(OPS)筛查约40 million个经CRISPR扰动的人类细胞,找出妨碍Ebola复制的宿主基因。

    推荐理由:研究将光学池化CRISPR筛选与AI成像分析结合,定位Ebola感染阶段的宿主依赖因子,为高致死病毒靶点发现提供可扩展路径。