bioRxiv · Bioinformatics· Song, Y. C., Ayala-Ortiz, C. O., Stratton, K. G., Chakrawal, A., Graham, E. B. ·· 1 天前AI 评分40
基因组尺度代谢模型揭示土壤细菌中与氨基酸发酵相关的代谢性状的系统发育保守性
Genome-scale metabolic models reveal phylogenetic conservation of amino acid fermentation-linked metabolic traits in soil bacteria
AI 导读
研究团队构建了美国大陆94份土壤样本中550个MAG的基因组尺度代谢模型集合，并用FBA检验系统发育保守性。FBA估算44种交换代谢物的摄取和分泌，整体信号较弱（median r = 0.029），但8种代谢物显著保守；多数细菌MAG被预测输入支链氨基酸，部分还分泌pyruvate和ethanol，提示候选交叉喂养关系。
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