土壤细菌发酵代谢性状的保守性
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土壤细菌发酵代谢性状的保守性
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AI 综述
Song等研究者在预印本中构建了美国大陆94份土壤样本中550个MAG的基因组尺度代谢模型,估算44种交换代谢物的摄取与分泌。结果显示相关代谢性状的系统发育保守信号整体较弱(相关系数中位数0.029),但其中8种代谢物呈显著保守。 模型预测多数细菌MAG能够摄取支链氨基酸,部分还可分泌丙酮酸和乙醇,提示这些代谢物可能参与土壤细菌之间的候选交叉喂养关系。
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最新进展11月4日 00:00
基因组尺度代谢模型揭示土壤细菌中与氨基酸发酵相关的代谢性状的系统发育保守性报道时间线
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11月4日
- bioRxiv · Bioinformatics基因组尺度代谢模型揭示土壤细菌中与氨基酸发酵相关的代谢性状的系统发育保守性
研究团队构建了美国大陆94份土壤样本中550个MAG的基因组尺度代谢模型集合,并用FBA检验系统发育保守性。FBA估算44种交换代谢物的摄取和分泌,整体信号较弱(median r = 0.029),但8种代谢物显著保守;多数细菌MAG被预测输入支链氨基酸,部分还分泌pyruvate和ethanol,提示候选交叉喂养关系。
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