ChAI-Net 从 DNA 序列学习染色质共可及性的调控规则

研究团队将单分子长读长 footprinting 与深度学习结合，训练 ChAI-Net 从 DNA 序列预测小鼠胚胎干细胞中的位点特异性染色质共可及性图谱。模型解释与 in silico 实验显示，ChAI-Net 识别了增强子、启动子和 CTCF 结合位点中不同的序列 motif 组合，其中许多 motif 在平均可及性建模中未被发现。