ChAI-Net解析染色质共可及性序列规则
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ChAI-Net解析染色质共可及性序列规则
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AI 综述
Lee等将单分子长读长footprinting与深度学习结合，训练ChAI-Net从小鼠胚胎干细胞的DNA序列预测位点特异性染色质共可及性图谱。模型解释与in silico实验显示，增强子、启动子和CTCF结合位点分别对应不同的序列motif组合，其中许多组合在平均可及性建模中未被发现。
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最新进展10月31日 00:00
ChAI-Net 从 DNA 序列学习染色质共可及性的调控规则报道时间线
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10月31日
- bioRxiv · GenomicsChAI-Net 从 DNA 序列学习染色质共可及性的调控规则
研究团队将单分子长读长 footprinting 与深度学习结合，训练 ChAI-Net 从 DNA 序列预测小鼠胚胎干细胞中的位点特异性染色质共可及性图谱。模型解释与 in silico 实验显示，ChAI-Net 识别了增强子、启动子和 CTCF 结合位点中不同的序列 motif 组合，其中许多 motif 在平均可及性建模中未被发现。
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