bioRxiv · Bioinformatics· Angevin, L., Lipovac, J., Peterlongo, P., Roux, E., Vicedomini, R. ·· 1 天前AI 评分46
Sourmash 从长读长宏基因组准确定析菌株并保留基因内容
Sourmash accurately profiles strains from long-read metagenomes preserving gene content
AI 导读
Sourmash 准确定析长读长宏基因组菌株,并在 5 个 mock community 中保留功能基因内容。覆盖度充分时,它能精确识别菌株,或以共享高度保守基因内容的近缘菌株代表预期功能潜能;基因内容恢复 F1 为 0.942–0.998,丰度估计的菌株水平 Pearson 相关系数为 0.823–1。
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