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bioRxiv · Bioinformatics· Zhou, M., Johannes, F. ·· 1 天前AI 评分57

预印本提出vafSOMA统计模型检测植物细胞层固定体细胞突变

vafSOMA: Detecting cell-layer-fixed somatic mutations in plants

AI 导读

预印本提出vafSOMA统计模型,利用组织组成检测植物细胞层固定的体细胞突变并估算突变率。该模型兼容混样与细胞层富集样本,无需用户设定阈值,模拟表现接近事后选择的最佳变异等位基因频率阈值。重复器官分析提高了枝分生组织突变的检出率,杏数据显示混样测序可能低估约2–3倍;代码见 https://github.com/jlab-code/vafSOMA。

来源:bioRxiv · Bioinformatics · biorxiv.org