bioRxiv · Bioinformatics· Andrey, T., Bratishchikov, A., Anufriev, A. ·2026-11-03 00:00· 1 天前AI 评分34

连续拓扑可及性（RFA）作为 3D 感知 GRN 过滤器：与 eQTL 反相关且不预测 ΔRNA

Continuous Topological Accessibility (RFA) as a 3D-Aware GRN Filter: Anticorrelation with eQTL and No Prediction of ΔRNA

AI 导读

RFA 基于 Hi-C 接触计算拓扑可及性；作为 3D 感知 GRN 过滤器时，其与 eQTL 反相关（ρ=-0.09），且不预测 MCF10A 与 MCF7 间的 ΔRNA（p=0.87）。重排实验表明，该反相关源于局部距离衰减，而非 loops 或 TADs。