bioRxiv · Bioinformatics· Luo, C., Hu, M., Wu, Y., Guo, D., Wang, S., Lyu, Q. R., Liu, X. ·· 1 天前精选AI 评分77
GRAFT框架通过跨模态迁移实现跨细胞类型药物响应零样本预测
Cross-modal transfer enables zero-shot prediction of drug responses across cell types
AI 导读
GRAFT通过将遗传扰动响应跨模态迁移至化学扰动，在缺少目标情境药物测量时推断药物诱导的转录响应。在LINCS和外部上下文的基准评测中，GRAFT相较竞争方法改善了响应相关性、方向一致性和幅度重建，对情境依赖型药物尤其明显。GRAFT-Adapt利用少量目标情境药物测量细化未测响应；GRAFT-Atlas覆盖13个细胞情境、7,856个药物目录条目并生成102,128个药物-情境预测。
推荐理由
GRAFT将遗传扰动响应迁移到缺少药物测量的目标情境，并结合少量目标情境药物测量进行适配，提供跨细胞类型零样本预测方法。
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