bioRxiv · Bioinformatics· Qi, X., Al Refaai, S. A., Muslinov, S., Panov, K. ·· 2 天前AI 评分34
营养缺乏的 U2OS 细胞中全基因组染色质可及性丧失与 RNA 丰度选择性升高并存
Genome-wide loss of chromatin accessibility coexists with selectively elevated RNA abundance in nutrient-starved U2OS cells
AI 导读
一项 U2OS 骨肉瘤细胞研究整合 ATAC-seq 与 RNA-seq，发现营养缺乏 18 h 后，全基因组染色质可及性下降，RNA 丰度却仅选择性变化。约 64% 的差异表达基因 RNA 丰度升高，启动子与增强子处，可及性与转录本丰度的相关系数分别为 0.25 和 0.10。两者共同仅解释 ~6% 的转录本丰度变化方差。
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