bioRxiv · Bioinformatics· Coppenbarger, E., Dapour, A. O., Andrews, R. J., Moss, W. ·2026-11-01 00:00· 2 天前AI 评分56

ScanFold3：快速识别基因组与转录组中有二级结构的 RNA 靶点

ScanFold3: a robust and rapid approach for identifying structured RNA targets in genomes and transcriptomes

AI 导读

ScanFold3 将共识 RNA 结构生成建模为图上的最小完美加权匹配问题，并用 C++ 优化关键计算组件。在最长 128 kb 的序列基准测试中，ScanFold3 相比 ScanFold2 加速 38-fold to 129-fold，并在经标注的人类 RNA 验证中取得更高 PPV。