ScanFold3加速RNA二级结构识别
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ScanFold3加速RNA二级结构识别
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Coppenbarger等提出并验证ScanFold3，将共识RNA二级结构生成建模为图上的最小完美加权匹配问题，并以C++优化关键计算。在最长128 kb的序列基准测试中，该方法较ScanFold2提速38至129倍，并在经标注的人类RNA数据验证中取得更高PPV。
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最新进展11月1日 00:00
ScanFold3：快速识别基因组与转录组中有二级结构的 RNA 靶点报道时间线
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11月1日
- bioRxiv · BioinformaticsScanFold3：快速识别基因组与转录组中有二级结构的 RNA 靶点
ScanFold3 将共识 RNA 结构生成建模为图上的最小完美加权匹配问题，并用 C++ 优化关键计算组件。在最长 128 kb 的序列基准测试中，ScanFold3 相比 ScanFold2 加速 38-fold to 129-fold，并在经标注的人类 RNA 验证中取得更高 PPV。
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