bioRxiv · Genomics· Putland, V., Robinson, H., Eglitis-Sexton, J. I. M., Yoshikawa, G. V., Hintzsche, J., Andrews, H., Andersen, S., Yoon, S., Tong, J., Mangila, L. M., Sree, A., Zanini, S., Schmidt, M., Zhang, Y., Snowdon, R. J., Golicz, A., Voss-Fels, K. P., Hickey, L. T., Crisp, P. A. ·· 1 天前AI 评分54
UMR-seq高通量测序揭示多种植物低甲基化组的广泛表观遗传变异
High-throughput sequencing of unmethylated DNA (UMR-seq) reveals extensive epigenetic variation in the hypomethylome of diverse plant species
AI 导读
UMR-seq通过一次经济且可扩展的检测，同时捕获基因组未甲基化区域并测序遗传变异。其在小麦中的成本为传统甲基化组测序的1/50，可用于群体尺度的遗传与表观遗传变异分析。研究发现UMR在植物营养组织间较稳定，但在胚乳中动态变化且在不同品系间差异显著；在187个精英小麦品种中，UMR分析改善了跨群体基因组预测，并发现与SNP结果大多不同的性状关联。
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