UMR-seq揭示植物低甲基化变异
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UMR-seq揭示植物低甲基化变异
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AI 综述
Putland等在bioRxiv预印本中提出UMR-seq,用一次检测同时捕获基因组未甲基化区域并测序遗传变异;在小麦中,其成本约为传统甲基化组测序的1/50,可用于群体尺度的遗传与表观遗传变异分析。 研究显示,植物营养组织间的UMR较稳定,胚乳中的UMR则动态变化且在不同品系间差异显著。对187个精英小麦品种的分析表明,UMR信息改善了跨群体基因组预测,检出的性状关联大多不同于SNP关联,为理解性状生物学和开展预测育种提供补充信息。
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最新进展11月4日 00:00
UMR-seq高通量测序揭示多种植物低甲基化组的广泛表观遗传变异报道时间线
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11月4日
- bioRxiv · GenomicsUMR-seq高通量测序揭示多种植物低甲基化组的广泛表观遗传变异
UMR-seq通过一次经济且可扩展的检测,同时捕获基因组未甲基化区域并测序遗传变异。其在小麦中的成本为传统甲基化组测序的1/50,可用于群体尺度的遗传与表观遗传变异分析。研究发现UMR在植物营养组织间较稳定,但在胚乳中动态变化且在不同品系间差异显著;在187个精英小麦品种中,UMR分析改善了跨群体基因组预测,并发现与SNP结果大多不同的性状关联。
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