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UMR-seq揭示植物低甲基化变异

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AI 综述

Putland等在bioRxiv预印本中提出UMR-seq,用一次检测同时捕获基因组未甲基化区域并测序遗传变异;在小麦中,其成本约为传统甲基化组测序的1/50,可用于群体尺度的遗传与表观遗传变异分析。 研究显示,植物营养组织间的UMR较稳定,胚乳中的UMR则动态变化且在不同品系间差异显著。对187个精英小麦品种的分析表明,UMR信息改善了跨群体基因组预测,检出的性状关联大多不同于SNP关联,为理解性状生物学和开展预测育种提供补充信息。

AI 根据报道生成 · 23 分钟前更新

报道时间线

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11月4日
  1. bioRxiv · Genomics
    UMR-seq高通量测序揭示多种植物低甲基化组的广泛表观遗传变异

    UMR-seq通过一次经济且可扩展的检测,同时捕获基因组未甲基化区域并测序遗传变异。其在小麦中的成本为传统甲基化组测序的1/50,可用于群体尺度的遗传与表观遗传变异分析。研究发现UMR在植物营养组织间较稳定,但在胚乳中动态变化且在不同品系间差异显著;在187个精英小麦品种中,UMR分析改善了跨群体基因组预测,并发现与SNP结果大多不同的性状关联。

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