bioRxiv · Bioinformatics· Hibi, T., Kojima, Y., Hayashi, S., Hisose, H., Mizukoshi, C., Shimamura, T. ·· 1 天前精选AI 评分75
CloneVI:深度生成模型解析细胞状态与线粒体基因型的克隆关系
CloneVI: A deep generative model for deciphering the relationships between cell state and mitochondrial genotype
AI 导读
CloneVI 研究团队提出深度生成模型,从单细胞基因表达或染色质可及性推断细胞状态,并结合线粒体 DNA 突变重建克隆结构与克隆概率。模型在模拟数据中恢复单克隆和混合克隆群体的真实结构,并在克隆性造血、慢淋白血病和多供体卵巢肿瘤数据中识别与特定细胞状态相关的突变细胞群。CloneVI 代码已公开:https://github.com/TaichiHIBI/cloneVI。
推荐理由
将线粒体DNA突变与单细胞表达或染色质状态联合建模,并输出克隆概率,为细胞谱系与状态关联分析提供可复用方法。
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