CloneVI推断细胞克隆结构与概率
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CloneVI推断细胞克隆结构与概率
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AI 综述
Hibi等开发深度生成模型CloneVI，利用单细胞基因表达或染色质可及性表征细胞状态，并结合线粒体DNA突变推断克隆结构及各细胞的克隆概率。模拟结果显示，模型能够恢复单克隆和混合克隆群体的真实结构。 在克隆性造血、慢淋白血病和多供体卵巢肿瘤数据中，CloneVI识别出与特定细胞状态相关的突变细胞群，代码已公开。
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最新进展11月4日 00:00
CloneVI：深度生成模型解析细胞状态与线粒体基因型的克隆关系报道时间线
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11月4日
- bioRxiv · Bioinformatics精选CloneVI：深度生成模型解析细胞状态与线粒体基因型的克隆关系
CloneVI 研究团队提出深度生成模型，从单细胞基因表达或染色质可及性推断细胞状态，并结合线粒体 DNA 突变重建克隆结构与克隆概率。模型在模拟数据中恢复单克隆和混合克隆群体的真实结构，并在克隆性造血、慢淋白血病和多供体卵巢肿瘤数据中识别与特定细胞状态相关的突变细胞群。CloneVI 代码已公开：https://github.com/TaichiHIBI/cloneVI。
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