bioRxiv · Bioinformatics· Prabakar, R. K., Meyer, H. V. ·· 1 天前精选AI 评分72
gcat 与 its_a_scam:用于单细胞数据处理和逐细胞质控的模块化工具
gcat, its_a_scam: modular tools for single cell data processing and per-cellquality control
AI 导读
Prabakar 与 Meyer 开发了 gcat 和 its_a_scam,用于模块化处理单细胞基因组数据并执行逐细胞质控。its_a_scam 基于 gcat,可配合开源工具生成 scRNA-seq 和 scATAC-seq 计数矩阵,并直接从比对文件计算逐细胞质控指标;在外周血单个核细胞 Multiome 数据集中,其计数矩阵与专有流程生成的结果高度一致。
推荐理由
提供模块化单细胞处理与逐细胞质控方案,并用 Multiome 数据比较其与专有流程生成结果的一致性。
来源:bioRxiv · Bioinformatics · biorxiv.org