开源单细胞分析与质控工具包
热点事件观察中
开源单细胞分析与质控工具包
1 篇报道1 个报道来源1 天前更新
先了解这件事
AI 综述
Prabakar 与 Meyer 开发并开源 gcat 和 its_a_scam,用于模块化处理单细胞基因组数据;在外周血单个核细胞 Multiome 数据集测试中,工具生成的计数矩阵与专有流程结果高度一致。 its_a_scam 基于 gcat,可配合常用开源工具生成 scRNA-seq 和 scATAC-seq 计数矩阵,并直接从比对文件计算逐细胞质控指标。Prabakar 与 Meyer 称,其模块化设计可接入既有流程并支持额外分析;gcat 以 gcatlib 名义发布,两套代码均已在 GitHub 公开。
AI 根据报道生成 · 49 分钟前更新
最新进展11月4日 00:00
gcat 与 its_a_scam:用于单细胞数据处理和逐细胞质控的模块化工具报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月4日
- bioRxiv · Bioinformatics精选gcat 与 its_a_scam:用于单细胞数据处理和逐细胞质控的模块化工具
Prabakar 与 Meyer 开发了 gcat 和 its_a_scam,用于模块化处理单细胞基因组数据并执行逐细胞质控。its_a_scam 基于 gcat,可配合开源工具生成 scRNA-seq 和 scATAC-seq 计数矩阵,并直接从比对文件计算逐细胞质控指标;在外周血单个核细胞 Multiome 数据集中,其计数矩阵与专有流程生成的结果高度一致。
本事件热度走势
还没有足够的连续观测数据,暂不绘制趋势。