长读长测序揭示 RNA 加工导致的实测异构体结构与丰度变化

SG-NEx 七个细胞系的测序显示，RNA 制备协议可显著改变实测异构体丰度与结构。direct RNA、direct cDNA 与 PCR 扩增 cDNA 存在数百个差异表达基因和异构体，数百个基因转录本使用也变化。主导性切换多涉及复杂结构；RT 和扩增后 exitrons 更多，m6A 高时 PCR counts 更少。