bioRxiv · Bioinformatics· Ren, L., Duren, Z. ·2026-11-03 00:00· 2 天前精选AI 评分78

REGA-perturb 解析遗传扰动通过基因调控路径的作用机制

Resolving how genetic perturbations act through gene regulatory paths

AI 导读

REGA-perturb 以参考表观基因组界定可能的 TF-调控元件-基因路径，并用共享潜在程序推断各路径如何响应遗传扰动。该方法基于 3 个 CRISPR 干扰筛选、共 2.4 million cells 的数据，区分了 TF 的直接与间接靶点，其相对随机基线的增益超过现有最佳方法的 4 倍。

推荐理由

将参考表观基因组作为调控路径支架，并用共享潜在程序解析扰动响应，展示了在单细胞数据中区分直接与间接靶点的方法框架。