RNA-Seq Blog· RNA-Seq Blog·· 3 小时前精选AI 评分73
Species-OT 利用 RNA sequencing 揭示跨物种功能相似基因
RNA sequencing reveals functional gene similarities across species
AI 导读
京都大学高等生命医学研究所开发 Species-OT，利用 RNA sequencing 在不同物种间识别可能具有相似功能的基因。该框架以 Gromov-Wasserstein optimal transport 比较 RNA sequencing 数据中的基因关系，并分析小鼠、猴和人类多能干细胞命运分化数据及六种哺乳动物的单细胞数据。
推荐理由
Species-OT 以 RNA 表达关系而非 DNA 序列为依据，为跨物种功能对应提供可复用的计算方法和开源实现。
来源：RNA-Seq Blog · rna-seqblog.com