Species-OT关联跨物种基因功能
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Species-OT关联跨物种基因功能
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AI 综述
京都大学高等生命医学研究所开发 Species-OT，利用 RNA 测序数据和 Gromov–Wasserstein 最优传输比较基因关系，识别不同物种间可能功能相似的基因。研究人员以小鼠、猴和人类多能干细胞命运分化过程中的批量 RNA 测序数据及六种哺乳动物的单细胞数据进行评估。 该框架目前识别的是候选对应关系，所预测的基因功能关系仍需实验验证。Species-OT 已作为可通过 pip 安装的 Python 包发布，源代码也已公开。
AI 根据报道生成 · 2 小时前更新
最新进展11月2日 20:12
Species-OT 利用 RNA sequencing 揭示跨物种功能相似基因报道时间线
沿着报道，了解事件的不同侧面。
11月2日
- RNA-Seq Blog精选Species-OT 利用 RNA sequencing 揭示跨物种功能相似基因
京都大学高等生命医学研究所开发 Species-OT，利用 RNA sequencing 在不同物种间识别可能具有相似功能的基因。该框架以 Gromov-Wasserstein optimal transport 比较 RNA sequencing 数据中的基因关系，并分析小鼠、猴和人类多能干细胞命运分化数据及六种哺乳动物的单细胞数据。
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