CARTnet用模板信息提升B细胞表位预测
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CARTnet用模板信息提升B细胞表位预测
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AI 综述
Roy 等在 bioRxiv 提出深度学习框架 CARTnet,把接触感知注意力、多模态特征与模板衍生的表位信息结合,用于从头预测和模板引导的 B 细胞表位预测。作者称该方法在内部和外部测试集上多数指标优于现有方法,AUPRC 分别为 0.243 和 0.267。 在模板引导版本中,引入单个模板残基的信息即可把 AUPRC 从 0.225 提升至 0.403;研究还显示 Alphavirus 的表位信息可迁移到近缘病毒。模型以 CC-BY-NC 4.0 许可发布。
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最新进展11月4日 00:00
CARTnet:基于接触感知注意力的模板引导 B 细胞表位预测报道时间线
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11月4日
- bioRxiv · BioinformaticsCARTnet:基于接触感知注意力的模板引导 B 细胞表位预测
研究提出 CARTnet:一种融合多模态特征与模板衍生表位信息的接触感知深度学习框架,用于从头及模板引导的 B 细胞表位预测。其内部与外部测试集 AUPRC 分别为 0.243 和 0.267。单个模板残基使模板版本 AUPRC 从 0.225 提升至 0.403,近缘病毒间的 Alphavirus 表位信息也可迁移。
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