乳腺癌多模态模型外部评估未超简化基线
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乳腺癌多模态模型外部评估未超简化基线
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AI 综述
Van An Nguyen 等在 bioRxiv 报告,他们把全切片图像、转录组、年龄和分期融合成多模态深度学习模型,用于预测乳腺癌 ER、PR 和 HER2 状态。模型在 TCGA-BRCA 的 1051 例患者上开发,在 CPTAC-BRCA 的 120 例中评估,外部 macro-AUC 为 0.936,未超过仅使用 ESR1、PGR、ERBB2 三个转录本的逻辑回归基线(0.957)。 论文称,该模型在各队列上的区分度较高,但相对这个简化基线没有表现出明确增益,跨队列校准仍是主要难题。此外,CPTAC 队列在模型早期开发阶段已被查看,其中 HER2 阳性病例只有 13 例,因此这次外部评估的独立性有限,HER2 亚组的样本支持也较弱。
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最新进展11月3日 00:00
乳腺癌 ER、PR 和 HER2 状态分类的多模态深度学习模型开发与跨队列评估报道时间线
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11月3日
- bioRxiv · Bioinformatics乳腺癌 ER、PR 和 HER2 状态分类的多模态深度学习模型开发与跨队列评估
研究团队开发了融合全切片图像、转录组、年龄和分期的多模态深度学习模型,用于乳腺癌 ER、PR 和 HER2 状态分类。模型在 TCGA-BRCA 1051例患者上开发,并在 CPTAC-BRCA 120例中评估,外部 macro-AUC 为0.936,未超过 ESR1、PGR 和 ERBB2 三转录本逻辑回归基线的0.957。
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