冷冻电镜重精修模型选择基准评测
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冷冻电镜重精修模型选择基准评测
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AI 综述
Yi等对冷冻电镜重精修后的模型选择策略进行基准评测,发现按最高相关性或留出半图选择模型,均比保留已沉积模型更偏离高分辨率参考,紧凑侧链的χ1偏差分别增加2.4°和2.29°。 主评测预指定3.0–3.6 Å队列,包含167个条目、131个序列组;最高相关性选择在91%的序列组中造成偏差上升。53组低、高分辨率配对中,该策略的偏差增加3.43°,留出半图策略增加2.35°。研究同时发布Primum,用固定队列、残基集和评分为再精修工具及选择规则提供对照基准。
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最新进展11月4日 00:00
cryo-EM 重精修中模型选择策略的基准评测报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月4日
- bioRxiv · Bioinformaticscryo-EM 重精修中模型选择策略的基准评测
研究团队基准评测了 cryo-EM 重精修中的模型选择策略,以保留已沉积模型作为无操作对照,并用高分辨率参考衡量紧密堆积侧链的一致性。预指定的 3.0–3.6 Å 队列包含 167 个条目和 131 个序列组,最高相关性选择使 χ1 偏差增加 2.4°(95% 区间 2.1–2.7°),其中 91% 的组偏差上升;使用重精修时留出的半图选择也使偏差增加 2.29°。
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