NEPTUNE预测神经元细胞死亡通路
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NEPTUNE预测神经元细胞死亡通路
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AI 综述
Padvi等开发了NEPTUNE,可从研究者提供的单细胞RNA测序差异表达基因列表中识别神经元细胞死亡标志物;应用于公开的rd1小鼠严重视网膜色素变性数据后,分析提示晚期光感受器死亡并非单纯凋亡,可能涉及相互重叠的细胞死亡程序。 使用该工具时,用户可获得包含倍数变化、影响方向、死亡类型和强度评分的标志物列表及可发表图表,工具网址为https://neptune.rgtcarvalholab.com/。
AI 根据报道生成 · 7 小时前更新
最新进展11月2日 00:00
NEPTUNE:基于单细胞 RNA-seq 的神经元细胞死亡通路预测工具报道时间线
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11月2日
- bioRxiv · BioinformaticsNEPTUNE:基于单细胞 RNA-seq 的神经元细胞死亡通路预测工具
Padvi 等开发了 NEPTUNE,从用户提供的单细胞 RNA-seq 差异表达基因列表中识别神经元特异性细胞死亡标记。团队将该工具用于公开的 rd1 小鼠严重视网膜色素变性数据集,分析显示晚期光感受器死亡并非纯粹的细胞凋亡,而可能涉及相互重叠的细胞死亡程序。
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