bioRxiv · Bioinformatics· Padvi, A. P., Brunet, A. A., Miller, A. L., Carvalho, L. S. ·· 2 天前AI 评分66
NEPTUNE:基于单细胞 RNA-seq 的神经元细胞死亡通路预测工具
NEPTUNE: a neuronal cell death pathway prediction tool used to decipher neurodegeneration using single cell RNA-seq datasets
AI 导读
Padvi 等开发了 NEPTUNE,从用户提供的单细胞 RNA-seq 差异表达基因列表中识别神经元特异性细胞死亡标记。团队将该工具用于公开的 rd1 小鼠严重视网膜色素变性数据集,分析显示晚期光感受器死亡并非纯粹的细胞凋亡,而可能涉及相互重叠的细胞死亡程序。
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