CRISP刻画单细胞空间信号交互

Sasson等提出CRISP，通过对应单细胞基因表达数据中多个概率信号特异投影，刻画单细胞与空间转录组中的跨信号交互。基于可调耦合模拟和四个相关数据集，研究显示该方法可识别多种信号交互，并将其定位到特定细胞亚群及相关基因群。 在肝脏数据中，CRISP区分健康与纤维化样本，将分区与位置耦合的丧失定位到纤维化肝细胞，并解析TGF–β反应、上皮间充质转化和细胞周期与特定亚群的非对称耦联；在疟原虫肝脏感染数据中，该方法识别出转录延迟的肝细胞，同时细化细胞标签、揭示连续转变并找出疾病相关基因。

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还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。