CRISP 揭示单细胞与空间组学中的跨信号交互

CRISP通过对应多个概率信号投影，刻画单细胞基因表达数据中的跨信号交互。研究基于可调耦合模拟和四个单细胞及空间转录组数据集，区分健康与纤维化肝脏样本，并将分区与位置耦合的丧失定位到纤维化肝细胞。CRISP还可解析TGF–β反应、EMT和细胞周期与特定细胞亚群的非对称耦联，识别疟原虫肝脏感染中转录延迟的肝细胞，并细化标签、揭示连续细胞转变及疾病相关基因。