MUTUAL统一单细胞RNA与ATAC分析
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MUTUAL统一单细胞RNA与ATAC分析
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AI 综述
Jiajun Zhu等提出跨模态单细胞模型MUTUAL，将转录组RNA与染色质可及性ATAC映射到共享空间；在10个未参与训练的数据集上，该模型无需重新拟合，模态匹配和ATAC-only细胞注释表现优于在同数据集其他供体上拟合的方法，并能将转录因子结合位点活性转移至RNA-only细胞。 模型冻结scFoundation和EpiAgent，将两者嵌入与两种模态的线性摘要结合，使用400个公开multiome数据集的300万个配对细胞学习统一RNA–ATAC空间。 在干细胞来源胰岛的成熟系列中，MUTUAL从RNA预测的结合位点活性在很大程度上重现了实测的阶段性变化；模型以CC-BY 4.0许可发布。
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最新进展11月2日 00:00
MUTUAL 单细胞多模态基础模型实现转录组与染色质可及性跨模态分析报道时间线
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11月2日
- bioRxiv · Bioinformatics精选MUTUAL 单细胞多模态基础模型实现转录组与染色质可及性跨模态分析
Jiajun Zhu 等提出 MUTUAL，将冻结的 scFoundation 与 EpiAgent 嵌入表示及两种模态的线性摘要结合，从 400 个公开 multiome 数据集的 3.0 million 个配对细胞中学习统一 RNA–ATAC 空间。
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