GeneFamHunter无需注释恢复基因家族成员

Klimov 与 He 开发并提出 GeneFamHunter，可在不依赖自动基因注释的情况下，直接从基因组核酸组装中恢复发散及串联排列的基因家族成员，工具以 Bash 编写、面向 Linux 与 SLURM 集群，以 MIT 许可免费提供。 在 6 个 Quest for Orthologs 基因组中，该方法的窗口式 HMMER 搜索找回了全部 130 个参考 C1A 位点，同时产生 21 个非目标命中；在 6 个螨类基因组中找回了全部 209 个已知 C1 位点，并识别出 37 个额外候选位点。作者称其可直接作用于核酸组装，从而省去注释步骤来寻找基因家族成员。

AI 根据报道生成 · 1 小时前更新

还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。