整合多组学揭示骨关节炎中FN1变化
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整合多组学揭示骨关节炎中FN1变化
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AI 综述
Lotz M.等在bioRxiv发表预印本,整合人膝关节软骨的转录组与表观基因组数据,发现骨关节炎进展伴随纤连蛋白(FN1)表达、剪接和受体信号协同变化,FN1受体使用由integrin α5β1转向CD44,并较弱地转向αvβ8。 分析覆盖92个膝关节、30名供者的108,600个软骨细胞核,并对其中24名供者进行单核多组学测序。九类软骨细胞随疾病分级形成按软骨区域和肥大分化排序的连续谱;4名早期骨关节炎供者中,tenascin-C已大幅诱导,FN1受体转换也已部分出现,而浅表软骨外FN1、FGF1及发育和骨化程序的上升随疾病进展出现。
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最新进展11月3日 00:00
人软骨转录组与表观基因组整合分析揭示骨关节炎进展中FN1表达、剪接及受体信号的协同变化报道时间线
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11月3日
- bioRxiv · Bioinformatics人软骨转录组与表观基因组整合分析揭示骨关节炎进展中FN1表达、剪接及受体信号的协同变化
人膝关节软骨转录组与表观基因组整合分析揭示,骨关节炎进展中FN1表达、剪接和受体信号发生协同变化。分析覆盖92个膝关节、30名供者的108,600个软骨细胞核及24名供者的单核多组学数据。随OA分级上升,ECM生成增强、稳态程序减弱,FN1受体使用由integrin α5β1转向CD44及较弱地转向αvβ8。
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