eQIF用隔离森林排序基因调控变异
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eQIF用隔离森林排序基因调控变异
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AI 综述
Schmidt等提出无监督机器学习方法eQIF,以隔离森林整合Enformer预测,为每个常见变异生成单一的基因调控优先级分数;在eQTL和调控型GWAS变异预测中表现强劲。研究发现,得分靠前的变异更常位于进化保守的转录因子结合位点,其在富集结合位点motif中的频率可反映motif的信息含量。 eQIF已预计算并公开9,431,969个常见变异的预测结果,供后续研究与使用。
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最新进展11月3日 00:00
eQIF:基于隔离森林的基因调控变异无监督优先排序报道时间线
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11月3日
- bioRxiv · BioinformaticseQIF:基于隔离森林的基因调控变异无监督优先排序
研究团队提出 eQIF,用隔离森林整合 Enformer 预测,生成单一基因调控分数,并在 eQTL 与调控型 GWAS 变异预测中表现强劲。靠前变异多位于进化保守的 TFBS 足迹,其在富集 TFBS motif 中的频率可复现 motif 信息含量。预测已预计算并公开,覆盖 9,431,969 个常见变异。
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