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Sun等提出RELAY细胞扰动预测模型

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AI 综述

Sun等在预印本中提出RELAY关系式上下文学习模型,用于预测未测条件下的细胞扰动响应。评估显示,在实验变量取值未见的场景中优于现有上下文方法,在扰动组合未见的场景中优于监督扰动预测方法。 RELAY利用共享实验变量的已测对照与扰动响应进行预测,模型只获知变量之间是否共享,不接收变量具体值;测试覆盖化学、遗传和细胞因子扰动数据集。作者计划开源包括代码和数据在内的全部资源。

AI 根据报道生成 · 3 小时前更新

报道时间线

沿着报道,了解事件的不同侧面。

11月3日
  1. bioRxiv · Cell Biology
    RELAY:通过关系式上下文学习预测细胞扰动响应

    RELAY 预印本提出关系式上下文模型,利用共享实验变量的已测对照与扰动响应,预测未测条件下的细胞响应。模型只接收变量是否共享的信息,不接收其具体值。该模型在化学、遗传和细胞因子扰动数据集上进行评估,未见变量值时优于现有上下文方法,未见组合时优于监督扰动预测方法;作者还计划开源包括代码和数据在内的全部资源。

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还没有足够的连续观测数据,暂不绘制趋势。