bioRxiv · Bioinformatics· Lu, J., Hou, H., Zhang, Z., Lin, Y., Lin, Y., Zhou, P. ·· 2 天前AI 评分65
LOTUS利用谱系感知最优传输重建连续克隆命运动态
LOTUS: lineage-aware optimal transport reconstructs continuous clonal fate dynamics
AI 导读
LOTUS提出一种融合时间分辨转录组快照与克隆谱系信息的框架，通过克隆级最优传输和神经非平衡传输，在谱系一致性约束下重建连续细胞命运动态。分支模拟中，非目标路由比例从4.94-14.84%降至1.10%；该方法还在LARRY造血、CellTagging成纤维细胞重编程及疟疾应答记忆CD4+ T细胞数据中重建轨迹并识别命运相关调控关系。
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