bioRxiv · Bioinformatics· Colgan, W. N., Weine, E., Koblan, L. W., Jones, M. G., Weissman, J. S., Yosef, N. ·· 1 天前精选AI 评分76
Pycea：用于单细胞谱系追踪分析的 scverse 工具包
Pycea: a scverse toolkit for single-cell lineage tracing analysis
AI 导读
研究团队发布 Pycea 及其 AnnData 扩展 TreeData，用于将细胞谱系树整合进单细胞分析工作流。TreeData 可与 Scanpy 及其他 scverse 工具兼容，无需在格式间转换；Pycea 提供可扩展的树可视化、支系识别、距离比较、祖先状态推断和谱系统计方法。软件已开源，代码见 https://github.com/YosefLab/pycea。
推荐理由
Pycea 将谱系树分析与 scverse 工作流整合，并提供可视化、支系识别和祖先状态推断等可复用方法。
来源：bioRxiv · Bioinformatics · biorxiv.org