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bioRxiv · Bioinformatics· Terrey, D., Huber, P., Pereira, E., Pelayo, M. C., Ferguson, R. M. W., Dumbrell, A. J., Sweet, M., Bani, A., Metz, S. ·· 1 天前AI 评分52

SeCAT 预印本:基于模拟检验的 Nextflow 流程用于跨研究整合 16S rRNA 宏条形码数据

SeCAT (Sequence Consensus Amplicon Trimming): a simulation-informed Nextflow pipeline for cross-study harmonisation of 16S rRNA metabarcoding datasets

AI 导读

研究团队在 bioRxiv 预印本中提出 SeCAT,一套面向跨研究整合 16S rRNA 宏条形码数据的 Nextflow 流程,把每项研究的扩增子变体映射到 16S rRNA 全长参考比对上,确定研究间共享的最大窗口,并在合并前用模拟检验裁剪是否损害群落结构。

来源:bioRxiv · Bioinformatics · biorxiv.org