bioRxiv · Bioinformatics· Li, T. Y., Chang, Y.-M., Chen, S.-Y. ·· 1 天前AI 评分62
BioTrajX 评估单细胞轨迹推断的生物学合理性
BioTrajX: evaluating biological plausibility in single-cell trajectory inference
AI 导读
Li、Chang 和 Chen 提出 BioTrajX R 包，以三项互补指标评估单细胞轨迹推断结果的生物学合理性。Directionality（D）、Order Consistency（O）和 Endpoint Validity（E）分别衡量伪时间与预期生物进程的一致性、标志物程序变化的连贯性，以及预期细胞状态在轨迹终点的富集。该框架还可用于比较替代轨迹推断结果，并在下游分析前评估根细胞选择。
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