bioRxiv · Bioinformatics· Scicluna, M. C., Ni, S., Valdez Cordova, C. M., Grenier, J.-C., Poujol, R., Kanoun, M. E., Rocha, J. F., Moon, K. R., Lemieux, S., Wolf, G., Krishnaswamy, S., Hussin, J. ·· 1 天前AI 评分38
PHATE 衍生祖先坐标捕捉人类基因组数据中的连续群体结构
PHATE-Derived Ancestry Coordinates Capture Continuous Population Structure in Human Genomic Data
AI 导读
研究人员提出基于 PHATE 的祖先坐标构建框架，用扩散轨迹嵌入捕捉人类基因组中的连续群体结构。在合成 benchmark 和大型基因组数据集上，适当的尺度调优与群体平衡可让 PHATE 恢复地理组织及混合梯度。研究同时指出，邻域尺度设置错误或群体失衡会扭曲群体结构表示，为连续遗传多样性可视化提供方法指导。
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