bioRxiv · Bioinformatics· Adhisantoso, Y. G., Schröder, S. K., Gress, M., Hernaez, M., Voges, J. ·2026-11-04 00:00· 1 天前AI 评分60

RAPTORGraph 预印本：基于图路径建模的单细胞扰动因果发现

RAPTORGraph: graph-based pathway modeling for causal discovery in single-cell perturbations

AI 导读

RAPTORGraph 预印本提出一种 β-变分自编码器，通过 GraphPathway 编码器学习路径中的基因间相互作用，用于单细胞扰动因果发现。模型以预条件化隔离被扰动基因的影响，形成可识别的单节点潜变量干预，并使用最优传输对齐处理 control 与 perturbed 样本。