CALMeR：基于上下文感知 MAPQ 建模的长读长转录本定量

CALMeR通过基于转录本属性和read级特征的上下文感知MAPQ建模，改进长读长RNA测序的转录本定量。它采用零一膨胀 beta 回归拟合每条alignment的期望MAPQ分布，保留多isoform基因和paralog family中符合情境的低MAPQ reads，并移除疑似artifact的异常低MAPQ reads。