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Nature Biotechnology· Alireza Karbalayghareh·· 12 天前精选AI 评分76

DynaVelo从单细胞多组学快照预测B细胞动力学、功能缺失与救援扰动

Deep dynamical models of single-cell multiomic velocities predict loss-of-function and rescue perturbations in B cells

AI 导读

DynaVelo从单细胞多组学快照建模B细胞动力学,并预测Arid1a、Ctcf功能缺失及其救援扰动。该生成式神经ODE联合建模RNA表达与TF motif可及性,恢复生发中心轨迹和动态基因调控网络。模型提出Ctcf、Bcl6、Stat3为Arid1a功能缺失的救援靶点,小鼠实验显示相应杂合双突变可将暗区/亮区比恢复至WT水平。

推荐理由

DynaVelo将单细胞快照转化为可扰动的动力学场,并以小鼠实验检验Ctcf、Bcl6和Stat3三个救援靶点。

来源:Nature Biotechnology · nature.com