bioRxiv · Bioinformatics· Joshi, D., Priyadarsinee, L., Chatterjee, B., Natarajan, A. M., Sastry, G. N. ·· 1 天前AI 评分41
FedEpitope:用于线性 B 细胞表位预测的参数高效联邦蛋白语言模型
FedEpitope: Parameter-Efficient Federated Protein Language Models for Linear B-Cell Epitope Prediction
AI 导读
FedEpitope 用 LoRA 将 ESM-2 适配到线性 B 细胞表位预测,数据保留本地,通信状态约 1.11 MB。FedAvg 与 FedProx 模拟评测使用 5 个按生物体划分的异质客户端;FedAvg 的平均 AP、F1 和 MCC 优于所有单客户端模型,并在 BCPreds 与 NetBCE 基准上测试泛化。
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