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只看模型#Arc Institute
10月20日周二
  1. Arc Institute · News64

    Arc Institute 发布 Bolero 细胞状态条件序列模型

    Arc Institute 发布 Bolero，以细胞状态嵌入动态调节序列到功能的 Transformer 模型，并将论文发布至 bioRxiv。模型使用原始 DNA 序列和源自 10.8-million-cell atlas 的 cell-state embedding，直接预测细胞状态特异的转录本丰度与染色质可及性。

    推荐理由：Bolero 展示了按细胞状态动态生成网络权重的方法，并给出跨物种预测、疾病变异评分和增强子设计案例。

10月6日周二
  1. Arc Institute · News82

    Arc Institute 发布利用人工整理生物知识的虚拟细胞模型 PIE

    Arc Institute 发布虚拟细胞模型 PIE，利用人工整理的生物知识预测未见细胞情境、扰动及其组合中的群体响应。在各设置下，PIE 分类差异表达基因的 AUPRC 达到最强竞争方法的 1.2 to 3.2 times，未见扰动时增幅最大，但情境与扰动均未见时准确率会下降。完整代码、训练与评测流水线已上 GitHub，模型检查点和处理后的公开数据集已发布在 Hugging Face。

    推荐理由：PIE将人工整理的生物知识作为输入，并给出跨未见扰动、细胞情境和数据集的对比结果，便于理解其泛化范围与限制。