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  1. Google DeepMind60

    Google Antigravity 新增 Biomolecular Structure Viewer,加速抗菌肽搜索

    Google Antigravity 引入 Biomolecular Structure Viewer,为研究者与 AI 智能体提供共享的 3D 结构查看和注释工作区。在抗菌肽案例中,ProtNLM 从 UniProt 原始氨基酸序列预测生物功能,平台结合结构与基因组证据筛出面向 Streptococcus pseudopneumoniae 的候选物。该候选物目前正在进行湿实验验证。

    推荐理由:技术演示呈现了 UniProt 功能预测、跨库检索和 3D 结构分析的一体化流程,提供了可迁移的候选抗菌肽筛选方法。

  1. Arc Institute · News69

    Arc Institute 等团队用 eclair-CLIP 构建 67 种 RNA 结合蛋白图谱

    Arc Institute、Biohub、UCSF 和 Vector Institute 团队开发 eclair-CLIP,并为人类细胞中的 67 种癌症相关 RNA 结合蛋白建立图谱,在单核苷酸分辨率下映射超过 9 million 个 RNA 结合位点。

    推荐理由:文章说明统一小标签和红外检测如何减少 CLIP-seq 对特异性抗体与放射性标记的依赖,并展示图谱进入模型训练后的应用路径。

  1. Isomorphic Labs · News78

    Isomorphic Labs 推出 IsoDDE 药物设计引擎

    Isomorphic Labs 推出 IsoDDE 药物设计引擎,用统一系统处理结构预测、结合亲和力预测和新型口袋识别。在‘Runs N’ Poses 基准最困难的外推类别中,IsoDDE 的准确率是 AlphaFold 3 的两倍以上,并在抗体-抗原高保真预测中分别比 AlphaFold 3 和 Boltz-2 高 2.3 倍和 19.8 倍。

    推荐理由:IsoDDE将结构预测、亲和力预测和口袋识别纳入统一系统,并提供训练集外任务与公开基准的对比结果。

  1. Chai Discovery · News80

    Chai-2 新研究验证全长药物样单克隆抗体设计及 GPCR 靶点拓展

    Chai Discovery 的新研究显示,Chai-2 已能进行全长药物样 mAb 的 de novo 设计,并扩展到六个 GPCR 和 peptide-MHC 靶点。

    推荐理由:提供 88 个 IgG 的可成药性数据与 Cryo-EM 结构验证,帮助读者判断 Chai-2 从亲和力设计走向药物样抗体的可用边界。

  1. Broad Institute · News73

    Broad Institute、MIT与Harvard University开发PUPS预测人细胞系中的蛋白质定位

    Broad Institute、MIT和Harvard University开发PUPS,可预测任意蛋白质在任意人细胞系中的单细胞定位,包括此前未测试的蛋白和细胞。

    推荐理由:PUPS将蛋白序列模型与图像补全模型结合,在未见蛋白和细胞系上实现单细胞定位,并提供实验验证与基线比较。

已经到底了