预印本界定抗真菌dsRNA广谱范围
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预印本界定抗真菌dsRNA广谱范围
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AI 综述
Wasif等在bioRxiv发表预印本,比较赤霉病菌11个经典抗真菌dsRNA靶基因与12种植物病原真菌转录组,发现完全匹配的21-nt siRNA位点不足以支撑跨属或跨纲的广谱喷雾诱导基因沉默。 研究覆盖4个分类纲的27,116个候选位点,其中2,108个(7.8%)能在至少一种其他病原体中保持21-nt完全匹配,且没有位点在8种或更多病原体中保守。因此,作者认为基于完全匹配的广谱dsRNA实际只能限于较窄的近缘类群,通常约为属级;更广范围需采用容错错配设计或病原体特异性构建体。
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最新进展11月2日 00:00
植物病原真菌经典抗真菌 dsRNA 靶基因的比较基因组学:保守 siRNA 长度窗口界定广谱喷雾诱导基因沉默范围报道时间线
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11月2日
- bioRxiv · Genomics植物病原真菌经典抗真菌 dsRNA 靶基因的比较基因组学:保守 siRNA 长度窗口界定广谱喷雾诱导基因沉默范围
研究比较了Fusarium graminearum的11个经典抗真菌dsRNA靶基因与12种植物病原真菌的转录组,覆盖4个分类纲。27,116个候选siRNA位点中,仅2,108个(7.8%)在至少一种其他病原体中保持21-nt完全匹配,无位点在8种或更多病原体中保守,完美匹配方案因而仅宜限于属级窄谱系。
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