Top2All评估稀疏输入转录组重建
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Top2All评估稀疏输入转录组重建
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AI 综述
Nishio、Yamashita与Baba开发基于Mouse-Geneformer的Top2All框架,以样本级稀疏基因输入重建转录组;在小鼠肾上腺束状带细胞的24份细胞数归一化RNA-seq谱、8种性别与性类固醇条件下,显式加入条件信息并未稳定提升重建效果。 重复留出及留一条件验证显示,最近邻检索比学习型重建更强,增加输入基因数也不保证性能单调改善。研究认为,少数高表达基因已包含转录组状态的大量信息,但准确重建基因层面的生物差异仍较困难。
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最新进展11月2日 00:00
Top2All 评测不同性别与性类固醇条件下由高表达谱重建转录组报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月2日
- bioRxiv · BioinformaticsTop2All 评测不同性别与性类固醇条件下由高表达谱重建转录组
Top2All 以 Mouse-Geneformer 为基础,在小鼠肾上腺束状带细胞的 24 个细胞数归一化 RNA-seq 谱和 8 种性别与性类固醇条件下评测稀疏输入的转录组重建。
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