ssGSEA3.0用特征级自助重采样评估通路显著性

Clark 与 Mani 在 bioRxiv 预印本中提出 ssGSEA3.0，把 ssGSEA/PTM-SEA 原有的特征标签（基因或位点水平）置换换成特征级自助重采样，用于更稳健地评估通路或签名活性，并称该做法在不同加权方案下都保持标定。 在已发表的肺腺癌和磷酸化蛋白组扰动数据集上，作者报告 ssGSEA3.0 的检测力高于 ssGSEA2.0-fixed，在方向性打分（PTM-SEA）上还有额外提升；代价是自助重采样使计算量增加约 1.5 至 2 倍。方法以开源 R 包形式发布（github.com/broadinstitute/ssGSEA3.0，DOI 10.5281/zenodo.23734262），并附有相应生物数据的示例。

AI 根据报道生成 · 45 分钟前更新

还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。