泛癌共表达框架区分谱系依赖与伪影

Khan等在bioRxiv发表预印本，提出泛癌共表达分析框架，用于区分同一基因在不同肿瘤谱系中的一致与非一致共表达程序，并处理三类分析伪影。 框架在各队列中重新计算与阈值无关的相关性，将转录本分为cis和trans集合，并以表达十分位匹配置换及拷贝数残差化控制伪影。应用于PTK2时，研究称其在17个TCGA队列中的预后关联方向随癌症而异，且独立于肿瘤纯度；拷贝数校正后，44个转录本的trans程序不变，而cis对照缩小38%，243个单细胞病例中有133例可在单个肿瘤内恢复共表达。

AI 根据报道生成 · 2 小时前更新

还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。